SUMMARY OF PM7 CALCULATION, Site No: 23746
MOPAC2016 (Version: 21.053M)
Wed Feb 24 08:42:37 2021
No. of days remaining = 363
Empirical Formula: C128 H224 N24 O40 Cl8 S8 = 432 atoms
MERS=(1,2,1) CHARGE=0 OUTPUT THREADS=1 PM7 GRADIENTS NOTXT EF
Methylene_blue_(MAPAZT10)
GEOMETRY OPTIMISED USING EIGENVECTOR FOLLOWING (EF).
SCF FIELD WAS ACHIEVED
HEAT OF FORMATION = -2861.74353 KCAL/MOL = -11973.53495 KJ/MOL
H.o.F. per unit cell = -357.71794 KCAL, for 8 unit cells, unit cell = C16 H28 N3 O5 Cl1 S1
TOTAL ENERGY = -38601.43515 EV
ELECTRONIC ENERGY = -221900315.10244 EV
CORE-CORE REPULSION = 221861713.66729 EV
VOLUME OF UNIT CELL = 1843.473 CUBIC ANGSTROMS
DENSITY = 1.477 GRAMS/CC
A = 30.177 ANGSTROMS
B = 6.582 ANGSTROMS
C = 9.308 ANGSTROMS
ALPHA = 85.655 DEGREES
BETA = 89.725 DEGREES
GAMMA = 89.828 DEGREES
VOLUME OF CLUSTER = 3686.94581 ANGSTROMS**3 = 2220.329 CM**3/MOLE
GRADIENT NORM = 22.22636 = 1.06937 PER ATOM
NO. OF FILLED LEVELS = 600
IONIZATION POTENTIAL = 8.518604 EV
HOMO LUMO ENERGIES (EV) = -8.519 -2.890
MOLECULAR WEIGHT = 3279.4184
Pressure required to constrain translation vectors
Tv( 433) Pressure: 0.43 GPa
Tv( 434) Pressure: 0.19 GPa
Tv( 435) Pressure: 0.15 GPa
SCF CALCULATIONS = 24
WALL-CLOCK TIME = 40 MINUTES AND 33.307 SECONDS
COMPUTATION TIME = 40 MINUTES AND 18.625 SECONDS
FINAL GEOMETRY OBTAINED
MERS=(1,2,1) CHARGE=0 OUTPUT THREADS=1 PM7 GRADIENTS NOTXT EF
Methylene_blue_(MAPAZT10)
Cl -0.03784661 +1 0.28970748 +1 -0.40772825 +1
Cl -4.19506109 +1 -14.64154947 +1 -0.58908318 +1
Cl -3.31881956 +1 0.75528816 +1 -3.60608739 +1
Cl -0.02067424 +1 -14.43259456 +1 -3.84881977 +1
C 1.59376079 +1 -8.20919861 +1 -0.70438317 +1
C 2.50036447 +1 -7.08487644 +1 -0.54115066 +1
C 2.99844575 +1 -12.19921264 +1 -0.46932756 +1
C 5.28387322 +1 -11.34571450 +1 -0.06161586 +1
C 6.07397915 +1 -0.97104251 +1 0.37585088 +1
C 3.96940808 +1 0.23836740 +1 -0.03025495 +1
C 2.03127850 +1 -9.48607082 +1 -0.64233891 +1
C 3.43620093 +1 -9.79109946 +1 -0.41880620 +1
C 4.34683635 +1 -8.68260868 +1 -0.29831165 +1
C 3.89736834 +1 -7.39866380 +1 -0.34842979 +1
C 4.09872320 +1 -4.65591046 +1 -0.22957096 +1
C 4.74883464 +1 -3.45660275 +1 -0.07808425 +1
C 4.01842755 +1 -2.22674458 +1 -0.09377397 +1
C 2.58846468 +1 -2.29966710 +1 -0.29301237 +1
C 1.95668242 +1 -3.49455728 +1 -0.44769792 +1
C 2.68912338 +1 -4.72934292 +1 -0.42419244 +1
H 0.53228824 +1 -7.97951305 +1 -0.87661497 +1
H 5.43718826 +1 -12.43218011 +1 0.10300234 +1
H 5.92382201 +1 -11.04311521 +1 -0.91793848 +1
H 5.65701271 +1 -10.83097422 +1 0.84497253 +1
H 6.39569112 +1 -1.73471222 +1 1.11064629 +1
H 6.66351545 +1 -1.09632427 +1 -0.55228744 +1
H 6.32920415 +1 0.01010815 +1 0.82458195 +1
H 4.58792813 +1 0.93005021 +1 -0.63956059 +1
H 2.98285497 +1 0.16363700 +1 -0.51975478 +1
H 3.82481025 +1 0.68825473 +1 0.97571331 +1
H 1.32473302 +1 -10.31693460 +1 -0.77050303 +1
H 5.42285113 +1 -8.89849342 +1 -0.17610858 +1
H 5.83541369 +1 -3.42895327 +1 0.06592150 +1
H 2.00155674 +1 -1.37613003 +1 -0.29063839 +1
H 0.86754231 +1 -3.54396447 +1 -0.57668797 +1
H 2.55348845 +1 -12.47655945 +1 0.50454868 +1
H 3.56686639 +1 -13.08024911 +1 -0.84286939 +1
H 2.17575162 +1 -12.01752746 +1 -1.19383659 +1
N 1.98381609 +1 -5.86935239 +1 -0.57875223 +1
N 3.87566942 +1 -11.04286335 +1 -0.32019217 +1
N 4.64092913 +1 -1.05411159 +1 0.09018098 +1
S 5.04898358 +1 -6.11298376 +1 -0.17106895 +1
C 3.79112334 +1 6.83008597 +1 0.15088168 +1
C 2.93787092 +1 7.99860849 +1 0.01498445 +1
C 2.18677770 +1 2.91381796 +1 -0.04159774 +1
C -0.05174746 +1 3.87430630 +1 -0.46211827 +1
C -0.37011565 +1 14.32229065 +1 -0.44320999 +1
C 1.80667862 +1 15.38890915 +1 0.00938682 +1
C 3.29321589 +1 5.57617568 +1 0.07548280 +1
C 1.87340795 +1 5.34176764 +1 -0.13853775 +1
C 1.01965548 +1 6.49425437 +1 -0.27133153 +1
C 1.53009607 +1 7.75458332 +1 -0.19793096 +1
C 1.45486423 +1 10.51115960 +1 -0.20015631 +1
C 0.85836282 +1 11.74590615 +1 -0.26911854 +1
C 1.63743689 +1 12.93918955 +1 -0.14707236 +1
C 3.06520805 +1 12.79204707 +1 0.02334631 +1
C 3.64498109 +1 11.56269791 +1 0.09023318 +1
C 2.85856027 +1 10.36433136 +1 -0.00239868 +1
H 4.86364981 +1 7.00450668 +1 0.31953263 +1
H -0.25758584 +1 2.79262718 +1 -0.59686352 +1
H -0.67516952 +1 4.22318813 +1 0.38916186 +1
H -0.40017754 +1 4.38352569 +1 -1.37981877 +1
H -0.72281671 +1 13.65953912 +1 -1.25545509 +1
H -0.96573401 +1 14.12661986 +1 0.46951593 +1
H -0.58303261 +1 15.35530966 +1 -0.78245295 +1
H 1.18403067 +1 16.13988392 +1 0.53784963 +1
H 2.71856280 +1 15.24630619 +1 0.61695178 +1
H 2.09840503 +1 15.80902450 +1 -0.97515722 +1
H 3.95970218 +1 4.71099120 +1 0.18739960 +1
H -0.06246199 +1 6.33239835 +1 -0.41261244 +1
H -0.22331600 +1 11.83193339 +1 -0.42603820 +1
H 3.69332210 +1 13.68623518 +1 0.07183589 +1
H 4.73223431 +1 11.45793450 +1 0.20177876 +1
H 2.59989994 +1 2.58420117 +1 -1.01230752 +1
H 1.57601215 +1 2.07743029 +1 0.36686117 +1
H 3.02796160 +1 3.06993324 +1 0.66924200 +1
N 3.50973330 +1 9.18734887 +1 0.09998293 +1
N 1.37095102 +1 4.11207191 +1 -0.21321849 +1
N 1.05624032 +1 14.14789461 +1 -0.16760311 +1
S 0.44557223 +1 9.10123036 +1 -0.35777815 +1
C 4.28735884 +1 9.00065914 +1 -3.08872151 +1
C 3.39002820 +1 7.87296958 +1 -3.24671939 +1
C 2.83809503 +1 12.97902398 +1 -3.19470204 +1
C 0.57281587 +1 12.12895665 +1 -3.67672051 +1
C -0.17013301 +1 1.71009942 +1 -3.86016614 +1
C 1.94916430 +1 0.53220187 +1 -3.43087607 +1
C 3.83919755 +1 10.27633462 +1 -3.13838185 +1
C 2.43296880 +1 10.56779143 +1 -3.35319476 +1
C 1.53579248 +1 9.45498369 +1 -3.50147301 +1
C 1.99645580 +1 8.17293161 +1 -3.45246678 +1
C 1.80529560 +1 5.42666466 +1 -3.50720643 +1
C 1.15927302 +1 4.22198983 +1 -3.60325145 +1
C 1.88957284 +1 2.99298040 +1 -3.50862470 +1
C 3.32239645 +1 3.07975871 +1 -3.31408101 +1
C 3.95276924 +1 4.27972491 +1 -3.22110700 +1
C 3.21682711 +1 5.51452859 +1 -3.30151229 +1
H 5.35171588 +1 8.78122185 +1 -2.92138606 +1
H 0.45985591 +1 13.18052360 +1 -4.00517246 +1
H -0.04329761 +1 11.99401409 +1 -2.76257780 +1
H 0.14324439 +1 11.49276795 +1 -4.47410049 +1
H -0.49926081 +1 2.40979295 +1 -4.65340456 +1
H -0.75011920 +1 1.90496375 +1 -2.93712248 +1
H -0.43225508 +1 0.69620670 +1 -4.22737668 +1
H 1.31148889 +1 -0.16731124 +1 -2.84685125 +1
H 2.90752832 +1 0.62360754 +1 -2.88790761 +1
H 2.14801984 +1 0.07612556 +1 -4.42408185 +1
H 4.53980026 +1 11.10967063 +1 -3.00577260 +1
H 0.46024137 +1 9.66221001 +1 -3.63296857 +1
H 0.07467262 +1 4.18436018 +1 -3.76409807 +1
H 3.91030528 +1 2.15614223 +1 -3.26916942 +1
H 5.04085768 +1 4.33959249 +1 -3.09205247 +1
H 3.26735918 +1 13.32846532 +1 -4.15085807 +1
H 2.25612806 +1 13.81703120 +1 -2.75417127 +1
H 3.66810593 +1 12.76562798 +1 -2.48757512 +1
N 3.91388574 +1 6.65662614 +1 -3.17953113 +1
N 1.97923188 +1 11.81935585 +1 -3.41494972 +1
N 1.26631086 +1 1.81334004 +1 -3.59666787 +1
S 0.85487431 +1 6.87718079 +1 -3.63537161 +1
C 2.08070824 +1 -6.04288464 +1 -3.93241602 +1
C 2.92393850 +1 -7.22001942 +1 -3.80809704 +1
C 3.69733193 +1 -2.14874695 +1 -3.56979369 +1
C 5.93546992 +1 -3.13247923 +1 -3.18845588 +1
C 6.13971253 +1 -13.55453896 +1 -3.06372103 +1
C 3.95774717 +1 -14.62455657 +1 -3.46916821 +1
C 2.58822547 +1 -4.79461564 +1 -3.83084058 +1
C 4.00718123 +1 -4.57546743 +1 -3.60083164 +1
C 4.85620199 +1 -5.73594835 +1 -3.51976227 +1
C 4.33609168 +1 -6.99106881 +1 -3.60954452 +1
C 4.38144386 +1 -9.74546803 +1 -3.57283560 +1
C 4.96074035 +1 -10.98383645 +1 -3.45150282 +1
C 4.16030027 +1 -12.16896176 +1 -3.49533184 +1
C 2.73530550 +1 -12.00779016 +1 -3.68329034 +1
C 2.17399352 +1 -10.77490447 +1 -3.80747999 +1
C 2.97773302 +1 -9.58536095 +1 -3.76087737 +1
H 1.00754527 +1 -6.20524562 +1 -4.10858363 +1
H 6.13606801 +1 -2.06781493 +1 -2.95548385 +1
H 6.56326811 +1 -3.41006938 +1 -4.06183935 +1
H 6.28279317 +1 -3.71857886 +1 -2.31530457 +1
H 6.49875823 +1 -12.84336532 +1 -2.29529197 +1
H 6.73692807 +1 -13.42264531 +1 -3.98685507 +1
H 6.33903875 +1 -14.56776003 +1 -2.65775672 +1
H 4.54668319 +1 -15.36978736 +1 -4.04493598 +1
H 2.99836759 +1 -14.49007722 +1 -4.00009367 +1
H 3.74615604 +1 -15.04756915 +1 -2.46271007 +1
H 1.92865068 +1 -3.92362098 +1 -3.92594207 +1
H 5.94179005 +1 -5.58358032 +1 -3.39029005 +1
H 6.04427517 +1 -11.07779702 +1 -3.30951976 +1
H 2.09479487 +1 -12.89511560 +1 -3.69521901 +1
H 1.08887987 +1 -10.65847282 +1 -3.92733791 +1
H 3.23110511 +1 -1.90830278 +1 -2.59560196 +1
H 4.31704604 +1 -1.27637652 +1 -3.87097797 +1
H 2.89284702 +1 -2.25161358 +1 -4.33005317 +1
N 2.33976733 +1 -8.40342486 +1 -3.88239269 +1
N 4.51582065 +1 -3.35278581 +1 -3.46758779 +1
N 4.71314191 +1 -13.37971137 +1 -3.34311837 +1
S 5.41280061 +1 -8.34618602 +1 -3.47603661 +1
H -1.26096028 +1 -12.83203946 +1 1.09928582 +1
H -2.21007547 +1 -13.50453113 +1 0.09030700 +1
O -1.63845302 +1 -12.73061207 +1 0.21035040 +1
H -2.83956093 +1 2.27272394 +1 -2.01610686 +1
H -1.94841030 +1 1.54453743 +1 -0.99107098 +1
O -2.46378049 +1 2.35578096 +1 -1.12239991 +1
H -3.03087762 +1 14.03507207 +1 1.46238319 +1
H -2.05718096 +1 14.54608058 +1 2.54845103 +1
O -2.67602185 +1 13.82700075 +1 2.34562101 +1
H -0.50158633 +1 -1.28128829 +1 -1.98556637 +1
H -1.43748309 +1 -0.56641132 +1 -2.97681066 +1
O -0.89496088 +1 -1.36180599 +1 -2.87019471 +1
H -1.65490907 +1 -8.36180216 +1 0.39796994 +1
H -1.47401876 +1 -7.36519599 +1 -0.76924298 +1
O -1.75750586 +1 -8.26990677 +1 -0.55775277 +1
H -2.25094280 +1 6.79979133 +1 -1.44476669 +1
H -2.38427650 +1 7.76315067 +1 -0.24004466 +1
O -2.14532964 +1 6.85461098 +1 -0.48542928 +1
H -2.63692220 +1 9.42642831 +1 1.84989065 +1
H -2.78992723 +1 8.43869219 +1 3.03077786 +1
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N 2.81845085 +1 -5.81027297 +1 -7.11434653 +1
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N 5.46862547 +1 -1.00107981 +1 -6.40887850 +1
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N 2.23136421 +1 4.15972936 +1 -6.74482474 +1
N 1.90347515 +1 14.19132740 +1 -6.68727053 +1
S 1.30091244 +1 9.14978245 +1 -6.88025632 +1
C 5.13621399 +1 9.08850422 +1 -9.62216111 +1
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S 1.69905115 +1 6.96354532 +1 -10.14913278 +1
C 2.92397416 +1 -5.93537447 +1 -10.45189474 +1
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